Перший свій матч збірна Гондурасу провела в 1921 році і була розгромлена Гватемалою з рахунком 10:01 . Тривалий час Гондурас не міг похвалитися великими успіхами на футбольному полі , обмежуючись локальними успіхами , такими , як перемога над слабкою збірної Нікарагуа в 1946 році з рахунком 13:00 . Починаючи з 1960 -х рр. . рівень і інтерес до футболу в країні повільно , але вірно став зростати .

Програш збірної Гондурасу збірної Сальвадору в 1969 році в півфіналі відбіркового етапу чемпіонату світу з футболу , з'явився одним з безпосередніх приводів до Футбольної війні - збройного конфлікту між цими країнами.

Перший « Золотий період» в історії збірної Гондурасу припав на початок 1980 -х років. Гондурас був обраний місцем проведення чемпіонату КОНКАКАФ для збірних ( нині іменований Золотий кубок КОНКАКАФ) . Гондурасці блискуче провели турнір , обігравши всі збірні , які посіли в таблиці місця нижче 4 -го ( 4:0 - Гаїті , 2:0 - Куба , 2:1 - Канада ) , і зігравши внічию 0:0 з двома призерами турніру - Сальвадором і Мексикою - і посіли перше місце на турнірі вперше у своїй історії.

Оскільки чемпіонат КОНКАКАФ 1981 був одночасно відбірковим турніром до чемпіонату світу 1982 року , Гондурас поїхав наступного року (разом з другим призером Сальвадором ) захищати честь Північної , Центральної Америки і країн Карибського басейну до Іспанії. Команда гідно провела турнір , хоча і не змогла вийти з групи - були здобуті нічиї з господарями турніру і Північною Ірландією ( по 1:1) , але мінімальна поразка від Югославії (0:1) не дозволила Гондурасу вийти в наступний раунд змагань.

У 1985 і 1991 роках Гондурас двічі займав 2 - е місце в Золотому кубку КОНКАКАФ.

У 2001 році Гондурас запросили в останній момент для участі в Кубку Америки , що пройшов у Колумбії. Гондурасці в чвертьфіналі сенсаційно обіграли збірну Бразилії , а в матчі за 3-е місце обіграли Уругвай . Таким чином , Гондурас зайняв призове третє місце у своєму єдиному участю в одному з найпрестижніших футбольних турнірів світу . Згодом Гондурас зізнавався однією з найбільш швидко прогресуючих футбольних націй світу за версіями журналу « World Soccer » , МФФІІС і ФІФА .

У 2009 році збірна Гондурасу посіла третє місце у фінальній відбірковій групі КОНКАКАФ і вдруге у своїй історії брала участь у фінальній стадії чемпіонату світу з футболу 2010 в ПАР, де взяла тільки одне очко , зігравши внічию зі Швейцарією (0:0) . Дві що залишилися зустрічі з Чилі та Іспанією « катрачос » програли і посіли останнє місце в групі , не забивши жодного м'яча.